به گزارش ایراف، حمدالله فطرت در یادداشتی اظهار کرده است که برخی از مقامات پاکستانی به‌جای رسیدگی فوری به این حادثه و تلاش برای نجات سربازان خود از طریق مذاکرات، انگشت اتهام را به‌سوی افغانستان نشانه رفتند.
وی در ادامه گفته است: جای تعجب است که حکومتی، فعالیت‌های گروهی را که از میان ملت خودش برخاسته و از زمان تأسیس پاکستان علیه حکومت این کشور فعالیت نظامی داشته است، به افغانستان نسبت دهد و مدعی شود که این گروه از داخل افغانستان مدیریت می‌شود؛ درحالی‌که این گروه سال‌هاست در داخل خاک پاکستان پایگاه دارد و به‌طور منظم و گسترده عملیات نظامی انجام می‌دهد.
وی این ادعاها را نشانه‌ای آشکار از ناکامی نظامی و استخباراتی حکومت پاکستان در تأمین امنیت کشور و مدیریت مشکلات داخلی آن دانسته و ادامه داده است؛ با نگاهی کوتاه به گروه‌های مخالف حکومت پاکستان، برای هر فرد خردمندی واضح می‌شود که این گروه‌ها در داخل خاک پاکستان حضور دارند و دست به عملیات‌های بزرگی همچون تصرف مناطقی مانند خصدار و بولان – که از شهرستان های بزرگ این کشور محسوب می‌شوند – می‌زنند. بنابراین، چگونه ممکن است چنین عملیات‌ها از خارج مدیریت شوند؟
در پایان این یادداشت با ابراز تاسف از مرگ افراد بی‌گناه گفته شده که طالبان، چنین ادعاهای بی‌پایه را به‌دور از عقل و منطق می‌داند و صریحاً رد می‌کند. گ
فتنی است که شاخه رسانه‌ای و روابط عمومی نیروهای مسلح پاکستان در بیانیه‌ای اعلام کرده است که رهبران شبه‌نظامی مستقر در افغانستان در طول حادثه گروگان گیری قطار “جعفر اکسپرس” با استفاده از تلفن‌های ماهواره‌ای با مهاجمان در تماس بودند.
ارتش پاکستان با استناد به گزارش اطلاعاتی در پایان محاصره 36 ساعته قطار جعفر، اعلام کرد که ربودن یک قطار در بلوچستان توسط شبه نظامیان مستقر در افغانستان ترتیب داده شده است.
از سوی دیگر پاکستان پیشتر اعلام کرده که قصد دارد قطعنامه ای علیه هند و افغانستان به دلیل دست داشتن در فعالیت های تروریستی در سازمان ملل ارائه کند.
